Koji Morimoto est né le 26 décembre 1959 à Wakayama, préfecture d'Osaka. Il est diplômé de l'Institut de Design d'Osaka, et a commencé sa carrière d'animateur en 1979 pour des studio comme Madhouse notamment.

Il devient freelance en 1984, et après avoir été un des fondateur du Studio 4°C en 1986, il débute sa carrière de réalisateur en 1987 avec "Franken's Gear", segment de l'omnibus Robot Carnival. En 1988, il fut co-directeur de l'animation sur le mythique Akira. En 1991, il écrit et réalise son premier film "Tobe ! Kujira no piku" (Peek la baleine). Enfin en 1995, il réalisa le premier sketch de Memories, "Magnetic Rose".

Mais la plupart du temps, Morimoto crée surtout des clips et des court-métrages, le dernier en date etant le sketch "Beyond" pour Animatrix. Il a un rapport tres spécial avec la musique, élément catalyseur de son travail. Il est aussi réputé pour se faire refuser beaucoup de projets, et de passer enormement de temps sur les storyboards et recherches graphiques. Il rebondit toujours sur les refus pour ameliorer et revoir ses idées. Il tente de garder ce qu'il appelle une "tension" dans son travail, mélange d'enthousiasme, d'energie et de motivation.